В 1711 году во время Прутского похода с Иоанном случилось большое несчастье. Он был взят в плен татарами, которые отдали его за плату турецкому военачальнику. Иоанна вместе с остальными пленниками перевезли в Малую Азию. Там ему надлежало пройти трудные телесные и духовные испытания. Над русскими заключенными всячески издевались и жестоко били, заставляя отречься от христианской веры. Кто был слаб духом – сдавался и принимал мусульманство. Иоанн же смиренно сносил все побои и оскорбления. И сколько бы не истязал господин раба своего, тот не отступал. Безмерная вера пленника наконец смягчила душу турецкого хозяина. Более он не истязал Иоанна и оставил всяческие попытки обратить его в мусульманство. Вместо этого он поручил узнику уход за скотом и выделил ему место для постели.
Денно и нощно трудился Иоанн, беспрекословно и честно выполняя все поручения своего господина. Не роптал на судьбу и не жаловался, со смирением принимая испытание Божие. Кротость и исполнительность Иоанна вызывали у других рабов недовольство и они насмехались над ним. Но Иоанн продолжал трудиться, усердно молясь и оказывая помощь другим работникам, если требовалось. Со временем, за такую безмерную доброту и отзывчивость остальные рабы полюбили его, а хозяин даровал свободу. Но Иоанн продолжал выполнять свои обязанности, предпочтя остаться на прежнем месте. По ночам в конюшне Иоанн, остававшись в одиночестве, подолгу молился. Иногда, при полной темноте ходил он в храм святого Георгия преклонить колени на пороге его.
Много лет верой и правдой служил святой Иоанн Русский при турецком господине. В 1730 году праведник скончался. Узнав об этом хозяин послал за православными священниками и отдал им тело Иоанна для погребения. Множество христиан собралось проводить подвижника в его последний путь. Более трех лет мощей святого Иоанна не касался тлен. Впоследствии их помести в храме святого Георгия, где они стали во множестве являть чудеса Божьи. Слава о дивном святом распространилась на далекие расстояния. Его просили о помощи и русские, и турки, и армяне. Память святого исповедника Иоанна Русского празднуется 27 мая.