Духовное дело шло у святого не менее успешно, чем военное. Уже в 1900 году святой Варсонофий, который к этому времени звался послушником Павлом, был пострижен в мантию. Через два года отец Варсонофий получает сан иеродиакона, а в следующем году он становится иеромонахом. После этого святого Варсонофия назначают духовником Шамородинской женской обители.
В те времена Россия вступила в войну с Японией, и святой Варсонофий был мобилизован. На войне он был фронтовым священником, много помогал воинам, но непосредственного участия в военных действиях не принимал. В 1907 году святого Варсонофия награждают саном игумена, после чего он становится скитоначальником Оптиной пустыни. Столь быстрое продвижение по духовной лестнице объясняется тем, что монахи видели в святом Варсонофии истинную благодать и духовное рвение, которое было заметно невооруженным взглядом. В 1912 году преподобный Варсонофий становится настоятелем Старо-Голутвинского Богоявленского монастыря. Одновременно с этим святой получает сан архимандрита. Однако правил он монастырем меньше года, поскольку святого Варсонофия призвал к себе Господь.
Духовный сын преподобного Варсонофия, митрополит Трифон, на похоронах сказал, что духовный отец мог не только творить добро, но и любить всем сердцем. Игумен Иннокентий рассказывал о преподобном, как о «гиганте духа, без которого ни один настоятель монастыря не мог и шагу ступить». Святой Варсонофий, икона которого продается на нашем сайте, почитается православным людом 14 апреля. Мощи святого ныне хранятся во Владимирском храме, после обретения их 10 июля 1998 года.